Artigo à Prova de Futuro

Jornada de Open Science na Prática

Dr. Pablo Rogers

APRESENTAÇÃO

Pablo Rogers:

  • Professor na Universidade Federal de Uberlândia (UFU)
  • Finanças e Ciência de Dados
  • I’m not an TI guy
  • Coordenador do Psico&Econo_METRIA


Redes Sociais:

INSTRUÇÕES GERAIS

Site do Curso:

Aulas Gravadas:

INSTRUÇÕES GERAIS

Certificação:

  • Ao final do curso será emitido certificado
  • Toda reunião terá uma lista de presença
  • Para aqueles com 75% de presença
  • Responderem o questionário final
  • Informarem os documentos necessários

AGENDA

Observações:

  • Terças e quintas às 19:00
  • Em torno de duas horas, com 10 min de intervalo
  • Qualquer imprevisto “jogaremos as aulas para frente” ou reposição na segunda ou quarta
  • A comunicação se dará através de e-mails

PRÉ-REQUISITOS

Repositórios da Ciência Aberta

Open Science Framework (OSF)

Objetivos de Aprendizagem

Ao final deste módulo, você será capaz de:

  • Criar e configurar projetos no OSF, incluindo metadados, componentes hierárquicos e integrações
  • Conectar o OSF a armazenamentos em nuvem, gerenciadores de referências e repositórios de código
  • Criar e submeter pré-registros utilizando templates apropriados
  • Distinguir entre preregistration e registration
  • Gerar DOIs para projetos e componentes
  • Compartilhar projetos com colaboradores e gerenciar permissões
  • Publicar preprints através do OSF

Contextualização

Por que repositórios de Ciência Aberta?

  • Promovem transparência, acessibilidade e colaboração na pesquisa
  • Democratizam o conhecimento científico
  • Gerenciam todo o ciclo de vida da pesquisa
  • Cada repositório tem suas particularidades e propósitos específicos

Ecossistema de Repositórios

Repositórios Gerais:

  • Zenodo: CERN + OpenAIRE
  • Figshare: Comercial, visualização integrada
  • Mendeley Data: Elsevier
  • Harvard Dataverse: Rede institucional

Repositórios Especializados:

  • arXiv: Preprints (física, matemática, CS)
  • GitHub: Código e desenvolvimento colaborativo
  • OSF: Ciclo completo de pesquisa

Outros: Databrary, DataONE, DataCite, Dryad, GenBank, PubMed Central, etc.

Por que OSF?

OSF Research Lifecycle

Diferenciais:

  • Foco em todo o ciclo de vida da pesquisa
  • Ferramentas robustas de colaboração
  • Integração com múltiplas plataformas
  • Comunidade ativa
  • Código aberto e gratuito
  • Mantido pelo Center for Open Science

Recursos Principais do OSF

Funcionalidades:

  • Criar projetos de pesquisa hierárquicos
  • Carregar e publicar dados com DOI
  • Colaboração em equipe com controle de permissões
  • Integração com armazenamentos em nuvem (OneDrive, Google Drive, Box, Dropbox)
  • Integração com gerenciadores de referências (Zotero, Mendeley)
  • Integração com repositórios de código (GitHub, GitLab, Bitbucket)
  • Pré-registro e registro de estudos
  • Publicação de preprints

Demonstração Prática

Perfil no OSF

Estrutura do Perfil:

  • Informações pessoais e afiliações institucionais
  • ORCID vinculado
  • Projetos públicos e privados
  • Sistema de busca de projetos, registros e preprints
  • Configurações e add-ons

Buscas no OSF

Descobrindo Conteúdo

Sistema de Busca

Filtros Principais:

  • Subject: Áreas de conhecimento
  • Resource type: Projects, Registrations, Preprints

Filtros Adicionais (por tipo):

  • Projects: Associated preprint
  • Registrations: Template + categorias de recursos
  • Preprints: Tipo de preprint

Acesso: Search OSF (barra superior)

Projetos no OSF

Features Principais

Criando um Projeto

Estrutura Hierárquica:

  • Projeto Principal (nível superior)
    • Sub-projetos (componentes)
      • Sub-sub-projetos (hierarquias inferiores)

Exemplo: Lab de Pesquisa → Iniciativa de Pesquisa → Hipótese/Protocolo/Dados

Formulário de Criação:

  • Título (obrigatório)
  • Storage Location (escolher localização)
  • Description (opcional)
  • Template (opcional)

Componentes do Projeto

Overview:

  • Descrição do projeto
  • Metadatos estruturados
  • Colaboradores
  • Tags e palavras-chave
  • Subjects (áreas de conhecimento)
  • License e DOI

Files:

  • Upload de arquivos
  • Organização em pastas
  • Integração com add-ons

Wiki:

  • Documentação colaborativa
  • Suporte a Markdown
  • Versionamento automático
  • Múltiplas páginas

Outros:

  • Registrations
  • Analytics
  • Contributors
  • Settings

Add-ons em Projetos

Configuração por Componente:

  • Cada componente pode ter seus próprios add-ons
  • Conectar repositório GitHub específico
  • Vincular pasta OneDrive específica
  • Integrar biblioteca Zotero ao projeto

Pré-registro e Registro

Transparência Metodológica

Preregistration vs Registration

Preregistration:

  • Criado antes da coleta/análise de dados
  • Compromisso metodológico prévio
  • Mitiga vieses de confirmação
  • Distingue análises confirmatórias de exploratórias
  • Maior valor para transparência

Registration:

  • Documenta estudos já concluídos
  • Snapshot permanente do projeto
  • Pode ser criado em qualquer estágio
  • Registro imutável com timestamp
  • Útil para arquivamento

Ambos geram registros permanentes e imutáveis

Fluxo de Registro

Etapas:

  1. Design: Preencher formulário do template escolhido
  2. Submit form: Revisar informações
  3. Embargo (opcional): Até 4 anos
  4. Publish: Registro se torna público e imutável
  5. Connected Resources: Vincular outputs futuros

Templates de Preregistro

Uso Geral:

  • OSF Preregistration: Mais abrangente e recomendado
  • Open-Ended Registration: Flexível, sem estrutura rígida

Estudos Específicos:

  • Secondary Data Preregistration: Dados já coletados
  • Registered Report Protocol: Submissão a journals

Revisões:

  • Generalized Systematic Review: Revisões sistemáticas e meta-análises

Replicações:

  • Replication Recipe (Pre-Registration): Planejar replicações
  • Replication Recipe (Post-Completion): Documentar replicações

OSF Preregistration

Template Mais Utilizado:

  • Abrangente para diversos desenhos de pesquisa
  • Hipóteses e questões de pesquisa
  • Métodos de coleta de dados
  • Planos de análise detalhados
  • Critérios de exclusão/inclusão
  • Variáveis e instrumentos
  • Tamanho amostral e justificativa

Secondary Data Preregistration

Específico para Dados Secundários:

  • Análise de dados já coletados (por outros ou em projetos anteriores)
  • Questões sobre conhecimento prévio dos dados
  • Torna transparente o que já foi explorado
  • Essencial para bases públicas ou repositórios institucionais
  • Distingue análises planejadas de data fishing

Registered Report Protocol

Para Submissão a Periódicos:

  • Revisão por pares do protocolo antes da coleta (Stage 1)
  • Aceitação provisória baseada na qualidade metodológica
  • Coleta e análise após aprovação
  • Submissão dos resultados (Stage 2)
  • Publicação garantida, independentemente dos achados
  • Elimina viés de publicação

Embargo e Versionamento

Embargo:

  • Possibilidade de embargar por até 4 anos
  • Trabalhar sem exposição prematura a concorrentes
  • Histórico permanece preservado

Após Publicação:

  • Registro se torna imutável
  • Controle de versões interno mantido
  • Connected Resources permite vincular outputs futuros

Connected Resources

Criar Relacionamentos:

  • Vincular artigos publicados
  • Conectar datasets depositados
  • Linkar preprints
  • Associar apresentações e materiais suplementares
  • Criar rede rastreável entre protocolo e produtos finais

Única modificação permitida após criar um registro

Preprints

Compartilhamento Rápido de Resultados

OSF Preprints

Serviços Disponíveis:

  • OSF Preprints: Genérico (descontinuado para novos preprints)
  • PsyArXiv: Psicologia
  • SocArXiv: Ciências Sociais
  • Outros: Serviços disciplinares específicos

Campos de Entrada:

  • Mesmas seções independente do serviço
  • Metadados estruturados
  • Upload de arquivo (PDF)
  • Licença de uso
  • Conflitos de interesse

Submissão de Preprint

Etapas:

  1. Upload: Arquivo PDF do manuscrito
  2. Metadados Básicos:
    • Título
    • Autores e afiliações
    • Abstract
    • Palavras-chave
    • Disciplina/Subject
  3. Metadados Adicionais:
    • Licença (CC-BY recomendada)
    • Conflitos de interesse
    • Financiamento
  4. Supplemental Materials (opcional): Vincular projeto OSF
  5. Review & Submit

Benefícios dos Preprints

Vantagens:

  • Compartilhamento rápido de resultados
  • Estabelecimento de prioridade (timestamp)
  • Feedback da comunidade antes da revisão formal
  • Visibilidade e citações precoces
  • Acesso aberto imediato
  • Rastreamento de métricas (downloads, visualizações)

Dicas Práticas

Organização:

  • Nomeação consistente de arquivos
  • Estrutura hierárquica lógica
  • Documentação contínua no Wiki
  • Tags e metadados desde o início

Colaboração:

  • Definir permissões adequadas
  • Comunicação clara sobre mudanças
  • Versionamento explícito

Transparência:

  • Preregistrar sempre que possível
  • Documentar desvios do protocolo
  • Compartilhar materiais e dados
  • Vincular todos os outputs

Citação:

  • Gerar DOIs para componentes citáveis
  • Usar citações estruturadas
  • Manter ORCiD atualizado

Perguntas?


Contato:

📧 [pablorogers@ufu.br]

🌐 www.phdpablo.com

💬 Psico&Econo_METRIA